המצב הכלכלי בהפועל בית שאן, אינו מזהיר בלשון המעטה בשנים האחרונות. מידי עונה, הקבוצה נקלעת למשבר כלכלי לקראת אמצע/ סוף העונה. שחקנים בקבוצה טוענים כי מזה כחודשיים הם מקבלים הבטחות שווא מהנהלת הקבוצה כי המשכורות יועברו בקרוב. שחקן בקבוצה אמר ל"עפולהנט": "ההשבתה של האימונים הייתה אמורה להיות כבר לפני למעלה מחודש. התקופה הטובה שלנו שכמעט ונגענו במקום הראשון גרמה לנו לא להתעסק בנושא הזה, כמה עוד אפשר? שחקנים לוקחים הלוואות על מנת לגמור את החודש? חייבים כאן לשחקנים 3 משכורות".

בקבוצת האוהדים של הקבוצה התייחסו לשביתה וכתבו: "זו כבר הלנת שכר של שלושה חודשים. עד מתי זה ימשך כך? באיזה מקום עבודה מסכימים לקבל שכר רק לאחר שלושה חודשים? ביום שישי הקרוב תשחק הקבוצה בביתה מול צעירי כפר כנא ולמאמן איתן טייב, אין מושג מי יהיו השחקנים שיעמדו לרשותו.

מדוברות עיריית בית שאן נמסר בתגובה: "הרשות העבירה מתחילת העונה קרוב ל-700 אלף שקלים. במהלך החודש האחרון אושרה תמיכה לקבוצה ובתוך זמן קצר יועברו 600,000 שקלים נוספים. תמיכת העירייה בקבוצה היא חסרת תקדים בכל קנה מידה. מעולם לא תמכה עיריית בית שאן בקבוצת הכדורגל, כפי שהיא נתמכה ב-3 השנים האחרונות על ידי ראש העיר וסגנו. השכר לשחקנים עד חודש דצמבר שולם במלואו, ותוך זמן קצר ישולם השכר המעוכב על ידי החשב המלווה של העירייה".